1、两者都属高速并行配置模式。
SelectMAP是早期的FPGA两类配置模式之一，是相对于串行（Serial）配置而言的，与主串（Master Serial）和从串（Slave Serial）模式对应，SelectMAP也有主并（Master SelectMAP）和从并（Slave SelectMAP）两种模式。对于Xilinx Paltform Flash PROM，小容量的（1Mb-4Mb）XCF01S、XCF02S、XCF04S只能用于串行模式，而大容量的（8Mb-32Mb）XCF08P、XCF16P、XCF32P虽可用在串行模式，但为了提高加载速度，一般用在并行模式。
从Spartan-3E开始，Xilinx新一代FPGA增加了可使用第三方厂家生产的标准SPI（Serial Peripheral Interface）和BPI（Byte Peripheral Interface） 接口Flash两种模式，但SPI和BPI只有主模式，且BPI分“主加”（Master BPI -UP）和“主减”（Master BPI-DOWN）两种模式，前者从地址0开始递增加载，后者则是从最大地址（3FFFF）开始递减加载，这也意味着使用BPI模式时，如果Flash容量足够大，可以同时在Flash中存储2个版本的FPGA程序。

2、Xilinx新一代超大容量 Flash XL-XCF128X(128Mb)即可使用SelectMAP(通常是Slave)模式，也可使用BPI（通常是UP）模式。

3、SelectMAP只有8bit，而BPI则有8bit和16bit。

4、 SelectMAP模式FPGA没有地址线与Flash相连，Flash内部使用FPGA提供的CCLK递增递增；BPI模式FPGA直接提供23位地址A0·A22给Flash，这样在BPI模式下，Flash除了可以存放FPGA程序，在FPGA程序加载运行后还可用来随机存储普通数据。